流式細胞術是一種對快速直線流動狀態中的單列細胞或生物顆粒進行逐個、多參數、快速的定性、定量分析或分選的技術，具有檢測速度快、測量參數多、采集數據量大、分析全面、分選純度高、方法靈活等特點，已經成為近代科學研究中的熱門專題。

流式細胞儀一般是將待測細胞或微粒進行熒光染色后制成懸液標本,在一定氣體壓力下將待測樣品壓入流動室,用不含細胞或微粒的緩沖液(又稱鞘液)在高壓下從鞘液管噴出,鞘液管入口方向與待測細胞或微粒流成一定角度,使鞘液包繞著細胞或微粒高速流動,形成一個圓形的流束(即鞘流),待測細胞在鞘液的包裹下單行排列,由流動室的噴嘴噴出，形成細胞柱，依次通過流式細胞儀的檢測區域,經激發光激發后產生熒光信號。

流式細胞儀通常以激光作為發光源。經過聚焦整形后的光束，垂直照射在樣品流上，被熒光染色的細胞在激光束的照射下，產生散射光和激發熒光。